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[化工化学]

关于MS的DMOL3中COSMO问题

周小明实名认证 发表于 2016-7-23 11:18  
查看: 100233|回复: 20|显示全部楼层 |阅读模式
我用的是MS7.0版本,根据网上PPT 做的COSMO对丙烷计算,只有一个峰,但是那个PPT是有两个峰。# Task parameters
Calculate                     energy
Symmetry                      on
Max_memory                    2048
File_usage                    smart

# Electronic parameters
Spin_polarization             restricted
Charge                        0
Basis                         dnp
Pseudopotential               none
Functional                    vwn-bp
Aux_density                   octupole
Integration_grid              fine
Occupation                    fermi
Cutoff_Global                 3.7000 angstrom
Scf_density_convergence       1.0000e-006
Scf_charge_mixing             2.0000e-001
Scf_iterations                50
Scf_diis                      6 pulay

Basis_version       v4.0.0

# Enviroment Keywords
Cosmo          on
Cosmo_Grid_Size      1082
Cosmo_Segments     92
Cosmo_Solvent_Radius    1.300000
Cosmo_A-Matrix_Cutoff     7.000000
Cosmo_Radius_Incr           0.000000
Cosmo_A-Constant           1.882190
Cosmo_B-Constant            0.010140
Cosmo_RadCorr_Incr          0.150000
Cosmo_Atomic_Radii
1     1.300000
6     2.000000
7     1.830000
8    1.720000
9     1.720000
15    2.120000
16    2.160000
17    2.050000
35    2.160000
53    2.320000

# Print options
Print                         eigval_last_it

# Calculated properties

这个是INPUT文件
COSMO Results from DMol3

Note: COSMO for ideal conductor limit (fepsi= 1.0000)
  Basic Grid Size                  =   1082
  Number of Segments on an Atom    =     92
  Number of Segments on Hydrogen   =     32
  Solvent Radius    [au]           =   2.46
  A - Matrix Cutoff [au]           =  13.23
  factor for Outlying Charge corr  =   0.85
  maximum segment or cutoff radius =   1.33
  total number of segments         =    438
  number of charge corr segments   =    197




$coordinates xyz [au]                         and cosmo atom analysis:   radius   charge    area  charge density  (srad)
C             0.00000000000000   -2.41364434126353   -0.43192920481103   3.7795   0.0532    58.76     0.00090    6.2361
C             0.00000000000000    0.00000000000000    1.16114536428006   3.7795   0.0236    32.09     0.00074    6.2361
C             0.00000000000000    2.41364434126353   -0.43192920481103   3.7795   0.0527    58.14     0.00091    6.2361
H             1.67588733987112   -2.50592328577163   -1.66314202513200   2.4566  -0.0156    25.07    -0.00062    4.9133
H            -1.67588733987112   -2.50592328577163   -1.66314202513200   2.4566  -0.0153    25.07    -0.00061    4.9133
H             0.00000000000000   -4.11946558838795    0.75819191739532   2.4566  -0.0184    24.34    -0.00076    4.9133
H             1.66142782415209    0.00000000000000    2.41944865553968   2.4566  -0.0158    24.83    -0.00064    4.9133
H            -1.66142782415209    0.00000000000000    2.41944865553968   2.4566  -0.0159    24.83    -0.00064    4.9133
H            -1.67588733987112    2.50592328577163   -1.66314202513200   2.4566  -0.0154    25.29    -0.00061    4.9133
H             1.67588733987112    2.50592328577163   -1.66314202513200   2.4566  -0.0151    25.29    -0.00060    4.9133
H             0.00000000000000    4.11946558838795    0.75819191739532   2.4566  -0.0184    24.41    -0.00075    4.9133
$end


$cosmo_energy               [Hartree atomic units]       [eV]     [kcal/mol]
  Total energy                 =       -119.155042
  Total energy + OC corr.      =       -119.154986
  Dielectric energy            =         -0.000876      -0.024       -0.55
  Diel. energy + OC corr.      =         -0.000820      -0.022       -0.51

  Surface area of cavity [au]  =           348.133
  Total Volume of cavity [au]  =           543.513


$screening_charge
  cosmo           =   -0.02415
  corrected total =   -0.00028

和COSMO文件,
孤山野 发表于 2016-9-29 06:24   显示全部楼层
大家都不容易!
dengmxgz 发表于 2016-9-29 07:52   显示全部楼层
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maxinlan126 发表于 2016-9-29 08:23   显示全部楼层
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欢乐谷 发表于 2016-9-29 10:39   显示全部楼层
谢谢您的分享!
542708169 发表于 2016-9-29 12:16   显示全部楼层
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Kako 发表于 2016-9-29 13:52   显示全部楼层
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scw2007imu 发表于 2016-9-29 14:42   显示全部楼层
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男人、必自强 发表于 2016-9-29 15:24   显示全部楼层
谢谢您的分享!
limingx 发表于 2016-9-29 15:53   显示全部楼层
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